2025年，DeepSeek等人工智能大模型陆续亮相，在深刻改变人类工作、生活的同时，也在重塑着种业生态，AI育种、智慧育种已逐步迈入现实。
2025年7月，崖州湾国家实验室联合相关单位发布我国生物育种领域首个自主科学发现系统——″丰登·基因科学家″，填补我国在生物育种领域自主科学发现系统的技术空白。8月，中国科学院联合相关单位研发出世界首台智能育种机器人″吉儿″。
2025年8月底，中国科学家提出一个″AI辅助作物设计″的整合模型，将作物育种从依赖经验的传统方式，转变为数据驱动的精准设计过程。值得注意的是，高质量、标准化的数据是训练AI模型的基础，新技术的应用也必须严格遵守生物安全和相关法规要求。
与此同时，种业创新攻关与突破仍在持续，在10月公布的2025中国农业科学重大进展中，″破解复粒稻簇生之谜″等多项种业研究成果入选。12月19日，《科学》杂志在线发布2025年度十大科学突破，华中农业大学科研团队发现水稻耐高温基因的相关研究成果入选。此外，创制辅酶Q10水稻新种质、培育矮秆耐密玉米、无融合生殖与″克隆种子″持续突破、绿色营养超级稻概念引发关注……
据农业农村部，2025年我国种业科技创新已整体进入世界第一方阵。深入实施种源关键核心技术攻关、生物育种重大专项、国家重点研发计划、育种联合攻关和畜禽遗传改良计划，挖掘出一批调控作物产量和品质、动物高繁等具有重大应用价值的新基因，选育出优质高产水稻、节水抗病小麦、耐密宜机收玉米、高油高产大豆等优良品种。